\documentclass{article}
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\begin{document}

\def\afaire#1{{\bf Afaire : #1}}

{\Large\begin{center}
Réalisation de simulations pluri-mensuelles pour des travaux pratiques avec le modèle LMDZ
\end{center}}


\def\infol#1{{\bf #1 }}
\def\resol#1#2#3{#1$\times$#2-L#3} %




\section{Execution du script install\_lmdz.sh}

La première étape consiste à récupérer le script install\_lmdz.sh disponible sur le réseau, puis à l'exécuter {\em en aveugle} (après avoir changé les droits pour le rendre exécutable) :
\begin{verbatim}
wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/pub/install_lmdz.sh
chmod +x install_lmdz.sh
./install_lmdz.sh -bench 0 -parallel mpi_omp -name LMDZ
\end{verbatim}
Le script rapatrie les sources du modèle sur votre machine, les compile et lance une simulation globale de 5 jours sur une grille régulière 48x36x39.
Il n'est pas utile de réaliser à nouveau cette opération si vous disposé déjà d'une installation parallèle de LMDZ.

\section{Récupération du tutorial}

Récupérer ensuite le répertoire contenu dans le fichier \infol{tutorial.tar} de la façon suivante:
\begin{verbatim}
~/LMDZ/modipsl/modeles/LMDZ
wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/pub/Training/tutorial.tar
tar xvf tutorial.tar
cd TUTORIAL
\end{verbatim}

Vous pouvez modifier les fichiers se trouvant dans le répertoire \infol{DEF} ainsi que le script d'initialisation \infol{init.sh} pour faire des choix différents quant à la confguration.
Par défaut, cette installation met en place une configuration avec une grille de 48 longitudes, 32 latitudes et 35 niveaux verticaux avec un raffinement (Zoom) d'un facteur 2 centrer aux longitudes et latitudes \infol{clon} et \infol{clat} modifiables dans le fichier \infol{DEF/gcm.def}.

Vous pouvez ensuite initialiser la configuration en lançant le script
\begin{verbatim}
./init.sh
\end{verbatim}
qui vous créera si tout se passe bien un répertoire \infol{INITIAL} contenant les fichiers de démarrage \infol{start.nc} et \infol{startphy.nc} ainsi qu'un fichhier de conditions aux limites sur 360 jours (durée de l'année choisie pour ces simulations légères): \infol{limit.nc}.

Il créera également le répertoire \infol{SIMU0} dwcontenu sur lequel vous pourrez lancer une simulation de test:
\begin{verbatim}
cd SIMU1
./run_local.sh 2 2 gcm.e # Lancement de l'executable gcm.e sur 2x2 processeurs
\end{verbatim}

Si tout se passe bien, vous pouvez ensuite lancer une simulation sur plusieurs mois. Pour ce faire, il convient de partir du répertoire \infol{PROD0} qu'il est préférable
de dupliquer au préalable :
\begin{verbatim}
cp -r PROD0 JOLIESIMU
cd JOLIESIMU
\end{verbatim}

Vous pouvez à nouveau si vous le souhaiter modifier les fichiers par défaut contenus dans le répertoire \infol{DEF} sauf en ce qui concerne la définition de la rille (nombre de points, définition du zoom) dans la mesure où vous devez conserver la cohérence avec les fichiers de démarrage déjà créés.
Pour lancer la simulation sur plusieurs mois, il vous suffit alors, sur le répertoire \infol{JOLIESIMU} de lancer la commande 

\begin{verbatim}
./enchaine.sh &
\end{verbatim}

Ce script s'enchainera automatiquement d'un mois sur l'autre, pour effectuer les simulations successives sur des sous-répertoire de travail (working directory) dont les noms commences par \infol{WD}.

Vous pouvez contrôler où vous en êtes des simulations en regardant le fichier \infol{etat} ou en consultant la listes des fichiers \infol{histday*nc} récemment créés.






\end{document}

